Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAMA3Q16787 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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