Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMKK1-203ENST00000381769 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMD1-203ENST00000409643 2901 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH13-202ENST00000418404 6067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ECM2-201ENST00000344604 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP1-202ENST00000393430 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC110048.2-201ENST00000617013 6721 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LPA-203ENST00000614786 1713 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FITM2-201ENST00000396825 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCF-201ENST00000327470 4269 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OTOF-201ENST00000272371 7156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTR1A-205ENST00000487599 2726 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MASP1-202ENST00000296280 4015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SERINC3-202ENST00000342374 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC69-201ENST00000355417 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NWD1-201ENST00000379808 7254 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSL6-202ENST00000357096 6298 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA6D-202ENST00000618219 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-226ENST00000638276 1865 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CRISPLD1-201ENST00000262207 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SVEP1-201ENST00000374461 3257 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BHLHB9-201ENST00000361229 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF16-201ENST00000276816 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GGA3-213ENST00000582486 2319 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTC1-201ENST00000290378 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG4-203ENST00000394279 3431 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A8-210ENST00000545207 1622 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL669983.1-201ENST00000306634 318 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SERHL2-202ENST00000335879 753 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IGFL3-201ENST00000341415 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR194-2-201ENST00000384864 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms