Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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RYR3Q15413 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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RYR3Q15413 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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RYR3Q15413 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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RYR3Q15413 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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RYR3Q15413 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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RYR3Q15413 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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RYR3Q15413 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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