Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LTV1Q96GA3 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms