Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
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