Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA3Q9Y6Q9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms