Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF2Q9UNY4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms