Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKQ9UM73 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKQ9UM73 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms