Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSEQ9UL01 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSEQ9UL01 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms