Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAX2Q9UIW0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAX2Q9UIW0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms