Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO40Q9UH90 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO40Q9UH90 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms