Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DBF4Q9UBU7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms