Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms