Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNRD1Q9P1U0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms