Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GDE1Q9NZC3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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