Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXL2Q9NZ53 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXL2Q9NZ53 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms