Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYX4

CALY, Neuron-specific vesicular protein calcyon, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALYQ9NYX4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALYQ9NYX4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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