Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms