Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CWC25Q9NXE8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms