Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC39A9Q9NUM3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms