Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L1Q9NU39 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L1Q9NU39 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms