Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYRM2Q9NU23 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYRM2Q9NU23 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms