Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMSN1Q9NSI8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms