Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms