Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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LTBP3Q9NS15 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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