Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRN4Q9NRL3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRN4Q9NRL3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms