Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 416.91■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 189.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.337e-7■■■■■ 189.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 189.6
UTP3Q9NQZ2 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 189.6
UTP3Q9NQZ2 PACSIN2-212ENST00000634914 1431 ntTSL 513.64□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 189.5
UTP3Q9NQZ2 PDS5B-207ENST00000482955 581 ntTSL 322.12■■□□□ 1.136e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 OS9-222ENST00000552787 962 ntTSL 216.67■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 OS9-213ENST00000550372 503 ntTSL 415.51■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 OS9-223ENST00000553208 1022 ntTSL 313.55□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 FANCL-206ENST00000427708 864 ntTSL 513.48□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 FANCL-205ENST00000417361 545 ntTSL 313.26□□□□□ -0.298e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 PDS5B-208ENST00000493653 972 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 FANCL-208ENST00000449070 964 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 FANCL-207ENST00000446381 487 ntTSL 510.99□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 FANCL-204ENST00000403676 849 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 PDS5B-204ENST00000466078 1889 ntTSL 24.86□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 MAN1B1-212ENST00000542372 545 ntTSL 414.61□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.389e-7■■■■■ 189.4
UTP3Q9NQZ2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.664e-8■■■■■ 189.3
UTP3Q9NQZ2 C11orf70-204ENST00000530659 1261 ntTSL 1 (best)17.22■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 189.3
UTP3Q9NQZ2 C8orf34-204ENST00000349492 648 ntTSL 311.64□□□□□ -0.554e-8■■■■■ 189.3
UTP3Q9NQZ2 C11orf70-201ENST00000434758 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 189.3
UTP3Q9NQZ2 C11orf70-202ENST00000526781 845 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.874e-8■■■■■ 189.3
UTP3Q9NQZ2 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.084e-8■■■■■ 189.3
UTP3Q9NQZ2 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.164e-8■■■■■ 189.3
UTP3Q9NQZ2 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.674e-8■■■■■ 189.3
UTP3Q9NQZ2 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.684e-8■■■■■ 189.3
UTP3Q9NQZ2 RAB3IL1-205ENST00000531922 866 ntTSL 321.69■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 189.1
UTP3Q9NQZ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.779e-17■■■■■ 189.1
UTP3Q9NQZ2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.159e-17■■■■■ 189.1
UTP3Q9NQZ2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.899e-17■■■■■ 189.1
UTP3Q9NQZ2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.159e-17■■■■■ 189.1
UTP3Q9NQZ2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.099e-17■■■■■ 189.1
UTP3Q9NQZ2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.029e-17■■■■■ 189.1
UTP3Q9NQZ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.481e-6■■■■■ 189
UTP3Q9NQZ2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 189
UTP3Q9NQZ2 SFI1-206ENST00000417682 1817 ntTSL 518.52■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 189
UTP3Q9NQZ2 SFI1-212ENST00000452250 2625 ntTSL 215.71■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 189
UTP3Q9NQZ2 ARL8B-203ENST00000429403 709 ntTSL 519.97■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 188.8
UTP3Q9NQZ2 ARL8B-204ENST00000444332 732 ntTSL 219.69■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 188.8
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 221.48■■□□□ 1.033e-11■■■■■ 188.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 221.14■□□□□ 0.973e-11■■■■■ 188.7
UTP3Q9NQZ2 FAM193A-208ENST00000513350 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.74□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 188.7
UTP3Q9NQZ2 N4BP2-203ENST00000513269 5361 ntTSL 1 (best)9.6□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 188.6
UTP3Q9NQZ2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 188.5
UTP3Q9NQZ2 SFI1-228ENST00000524296 2108 ntTSL 516.77■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 188.5
UTP3Q9NQZ2 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 188.5
UTP3Q9NQZ2 SFI1-202ENST00000382162 5250 ntTSL 215.33■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 188.5
UTP3Q9NQZ2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 188.5
UTP3Q9NQZ2 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 188.5
UTP3Q9NQZ2 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 188.5
UTP3Q9NQZ2 ATP7B-214ENST00000634810 5825 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 188.5
UTP3Q9NQZ2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.467e-7■■■■■ 188.4
UTP3Q9NQZ2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 188.4
UTP3Q9NQZ2 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 188.4
UTP3Q9NQZ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.765e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.745e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)24.38■■□□□ 1.495e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCZ-215ENST00000479263 1747 ntTSL 223.42■■□□□ 1.345e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.825e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 218.26■□□□□ 0.515e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 USE1-208ENST00000600970 826 ntTSL 517.7■□□□□ 0.425e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.375e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.325e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCZ-214ENST00000478770 1542 ntTSL 215.95■□□□□ 0.145e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 USE1-205ENST00000594724 744 ntTSL 315.77■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 ZBTB34-201ENST00000319119 6564 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 USE1-203ENST00000593597 587 ntTSL 211.3□□□□□ -0.65e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.35e-8■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 ZZZ3-210ENST00000476275 4737 ntTSL 25.84□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 ZZZ3-211ENST00000481346 4500 ntTSL 1 (best)4.01□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 188.3
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-210ENST00000592115 1141 ntTSL 1 (best)21.14■□□□□ 0.975e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 TSPAN4-212ENST00000494815 2187 ntTSL 219.88■□□□□ 0.775e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 AGAP1-209ENST00000453371 2138 ntTSL 519.22■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-208ENST00000590925 648 ntTSL 1 (best)19.1■□□□□ 0.655e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.565e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 APOLD1-203ENST00000534843 2375 ntTSL 217.97■□□□□ 0.475e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 KIAA1328-210ENST00000592611 1798 ntTSL 216.99■□□□□ 0.315e-10■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 TSPAN4-211ENST00000468468 2777 ntTSL 216.99■□□□□ 0.315e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 AGAP1-210ENST00000466575 541 ntTSL 315.78■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-206ENST00000589892 747 ntTSL 215.49■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.035e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 OXNAD1-203ENST00000442255 1994 ntTSL 514.6□□□□□ -0.075e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-204ENST00000586192 524 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-205ENST00000587746 492 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 CLK3-216ENST00000564468 929 ntTSL 314.23□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.185e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 KIAA1328-204ENST00000587139 3256 ntTSL 513.22□□□□□ -0.295e-10■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.355e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 BIRC5-209ENST00000591800 496 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.395e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 OXNAD1-209ENST00000627468 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.425e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 ODF2-207ENST00000421776 1254 ntTSL 1 (best)10.5□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 188.1
UTP3Q9NQZ2 OXNAD1-201ENST00000285083 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 188.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 955.1 ms