Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NRIP3Q9NQ35 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms