Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE7BQ9NP56 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms