Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC24A3Q9HC58 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC24A3Q9HC58 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms