Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC52A2Q9HAB3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC52A2Q9HAB3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms