Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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