Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP4BQ9H444 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP4BQ9H444 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms