Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX5Q9H2C1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHX5Q9H2C1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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