Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC8Q9H0W5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC8Q9H0W5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms