Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms