Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF4Q9BZC1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms