Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDAC8Q9BY41 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms