Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms