Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SALL3Q9BXA9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL3Q9BXA9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms