Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms