Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms