Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PI4K2AQ9BTU6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms