Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms