Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TINF2Q9BSI4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms