Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF8Q9BRL6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms