Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF559Q9BR84 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF559Q9BR84 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms