Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREX2Q9BQ50 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms