Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM7Q9BQ49 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM7Q9BQ49 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms