Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYD88Q99836 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms